Perusahaan juga menerapkan teknologi Flue Gas Desulphurization (FGD) yang mampu menurunkan parameter pencemaran SO₂ secara signifikan, sehingga emisi gas buang yang dihasilkan PLTU memenuhi standar nilai baku mutu yang ditetapkan pemerintah.

Berkenaan dengan upaya pengurangan emisi karbon, Weda Bay Project juga mulai mengoperasikan dump truck listrik. Saat ini sudah terdapat dua stasiun pengisian dan penukaran baterai untuk truk-truk tersebut.